IP: Dr. Antonio José Caruz Arcos

Resumen del proyecto: La identificación de genes asociados con la protección contra la infección por VIH es esencial para comprender los mecanismos moleculares involucrados en el proceso de infección, la respuesta inmune innata y adaptativa frente al virus, identificar posibles dianas farmacológicas, mejorar la eficacia de las vacunas en desarrollo y aumentar la respuesta del paciente a la terapia. La identificación de factores inmunológicos, genéticos o ambientales relacionados con la protección posterior a la vacunación sería un gran avance en el desarrollo de vacunas contra el VIH-1. Hipótesis: La resistencia genética al VIH-1 y la eficacia de las vacunas está determinada por variaciones en la expresión, estructura y función de los genes de inmunidad innata. El genotipado paralelo de cohortes en riesgo de infección por VIH por vía sexual o parenteral, así como el estudio genético de voluntarios tratados con placebo/vacuna del ensayo clínico Vax004 podría permitir distinguir entre la genética de la respuesta a vacunas y la genética de la susceptibilidad al VIH. En un proyecto anterior financiado por el MINECO, hemos realizado un estudio de genoma completo de un conjunto de cohortes españolas de transmisión sexual (Córdoba, Jaén, Madrid) e internacionales (Milán-Italia, Vaxgen-San Francisco-USA) que nos han permitido descubrir nuevos biomarcadores asociados al riesgo de infección por VIH-1. De estas muestras (cohortes sexuales y Vaxgen) hemos realizado un genotipado con la plataforma Global Screening Array de Illumina (650.000 marcadores directos y 8 millones imputados). Habiéndose encontrando señales de asociación con riesgo de infección por VIH en los siguientes locus entre otros: • Cromosoma 4: Está asociada por GWAS con los niveles de linfocitos totales en sangre peri-férica. Además de otros fenotipos relacionados con la respuesta inmunitaria como asma o enfermedad inflamatoria intestinal. • Cromosoma 7: Región previamente asociada en otro GWAS a niveles de leucocitos y eosinófilos en sangre periférica, pero imperfectamente caracterizada. • Cromosoma 13: gen implicado en la activación funcional de genes inducidos por interferón, que generan una modificación postraduccional necesaria para su actividad antiviral (inhibición formación de poros de fusión entre membranas virales y celulares). En cuanto a la incidencia de infección post-vacunación, las señales genómicas encontradas son muy interesantes con un gen previamente asociado a la respuesta a la vacuna de la viruela, genes implicados en las uniones tipo Gap y lo más sorprendente, varios genes implicados en trastorno bipolar y esquizofrenia. Los datos solicitados al CEGEN de donantes sanos nos permitirán realizar estudios de asociación génica con pacientes VIH positivos infectados por vía sexual (Cohortes de Málaga y Lleida) y replicar en poblaciones independientes los datos obtenidos en el estudio anterior.

Entidad financiadora: Programa FEDER Andalucía 2014-2020