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Inicio » Proyectos de investigación » Estudio de la inestabilidad genómica en gliobastomas: utilidad de la genética en la subclasificación de los tumores.
Título: Estudio de la inestabilidad genómica en gliobastomas: utilidad de la genética en la subclasificación de los tumores.
IP: Dr. Álvaro Otero Rodríguez
Resumen del proyecto: Debido a la elevada heterogeneidad e inestabilidad gene tica de los tumores del sistema nervioso proponemos analizar en 30 glioblastomas multiformes (GBM) las alteraciones gene ticas en los 24 cromosomas identificando el número de copias de cada uno de los cromosomas en tejido tumoral y establecer el perfil de cada cromosoma en un solo experimento para después agrupar los tumores de acuerdo a la presencia de mutaciones del gen del receptor de crecimiento epidérmico (EGFR), analizar el impacto pronostico y utilizar dicha información en el manejo clínico de los pacientes. Datos previos nos han permitido conocer que la presencia de amplificaciones ge nicas del gen EGFR es una alteración frecuente (al menos afectaría a un tercio de los pacientes) pero a la vez heterogenea ya que puede encontrarse como una amplificación aislada o acompan ada de otras amplificaciones ge nicas (que afectan desde uno a varios genes afectando principalmente a genes situados en los cromosomas 12q, 4q y 1q como son MDM2, PDGFRA y MDM4), concomitante con otras ganancias y/o pérdidas cromosómicas y presencia o no de mutaciones en el gen EGFR (que originan un incremento en la proliferación y supervivencia de las células mutadas) siendo la mutación más frecuente la llamada variante III que consiste en la pérdida de 901 pb entre los exones 2-7 del gen. Pretendemos analizar los GBM que se intervengan en el Servicio de Neurocirugía del Hospital Universitario de Salamanca y posteriormente clasificar dichos tumores de acuerdo a las regiones pérdidas y ganadas y establecer grupos homogeneos (de acuerdo a las alteraciones y mutaciones detectadas), valorando el uso de los arrays como herramienta diagnostica y la posibilidad de utilizar la información gene tica obtenida para indicar tratamientos específicos cuando se involucren dianas gene ticas para las que se dispone de terapias específicas, como puede ser la presencia de amplificación del gene EGFR. El proyecto tiene 3 objetivos: clasificar los tumores, predecir su evolución y facilitar la toma de decisiones terapéuticas optimizadas y específicas en cada tumor. Para cumplir los objetivos planteados la metodología que se va ha utilizar es: 1–) Un "custom array" de ADN utilizando sondas de oligonucleotido de polimorfismo único (SNP arrays) que contienen sondas distribuidas en los 24 cromosomas que nos permitirá identificar las alteraciones del numero de copias de todos los cromosomas mediante el análisis global del genoma tumoral y establecer grupos homogéneos de tumores. 2–) Analizar la existencia de mutaciones (tipo y frecuencia) en el gen EGFR mediante secuenciación para valorar su relación con las alteraciones numéricas (número de copias) del gen y 3–) Definir grupos homogéneos de tumores a partir de las alteraciones gene ticas detectadas en cada tumor y relacionar las inestabilidad gene tica con las características clínicas de los pacientes.
Entidad financiadora: Junta de Castilla y León
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